如果根管治療滅菌不完全、牙套材質不良，或密合度不佳，都有可能導致牙根裡頭持續發炎、化膿的牙根間囊腫，如果不及時治療，通常牙齒內的細菌會慢慢侵蝕，甚至從一顆牙根傳染到另一顆牙根。牙根間囊腫又稱為根間牙周炎，指的是牙根裡發炎、化膿，暗藏許多細菌，才會導致疼痛，忽視的結果可能會造成蜂窩性組織炎，嚴重甚至擴大感染，後果不堪設想。

　　常聽到有人喊牙痛，其實可能已是骨床痛。牙醫師呂睿庭說，剛開始牙肉會生出小膿疱，這就表示細菌已累積到一定的量，必須尋找出口，也許刺破或服用消炎藥，暫時讓膿疱消失，但隨著之後長膿疱的機率愈頻繁，初期可能只有牙齒悶痛咬合不適感，一旦牙肉紅腫伴隨疼痛甚至臉部外觀有腫脹情形時，就得小心可能是急性牙髓炎了，如果腫脹到肌肉組織變硬，必須趕快掛急診為上策，否則可能會致命。

　　臨床上年輕人的根間發炎多半導因於根管出問題，老年人許多是因為牙周發炎所致的根尖發炎。呂睿庭說，如果是因為根管治療滅菌不完全，治療拖延太久未回診，未做牙套保護，或牙套材質不良導致牙肉過敏及金屬冠被腐蝕，都可能導致細菌沿著根管深入牙髓的可怕後果。

　　若是根管治療出問題，在治療根間牙周炎前，牙醫師會先依照X光片判斷，以先是否能拯救這顆牙為前提作治療，發炎的牙齒如有作假牙通常必須拆開原先假牙，重新進行放藥進入根管殺菌的療程，但若是殺菌不彰，再進行從牙根間及舌側打洞的「牙根間切除術」，將細菌完全清除乾淨；若是洞過大時，必須再進行補骨手術，如果怕痛的患者可以請醫師合併低疼痛雷射滅菌，可運用雷射高滅菌率提高成功率與降低疼痛感。如因罹患牙周炎造成的根間牙周炎，輕則進行根管治療滅菌，較嚴重時可合併進行根間切除術輔以牙周組織引導增生手術，若是重度牙周炎致牙齒動搖保不住，就必須採取拔牙的下下策，再進行牙齒咬合重建的工程。

　　根間牙周炎發作初期，牙齒咬合會有悶痛感，就應該提高警覺。牙醫師何擇榮提醒，如果只是單純牙周炎，外觀還不致很嚴重，若根管發炎、牙髓過度損耗時，就可能腫得像「豬頭」，而出現吞嚥困難，此時，牙肉膿疱變硬、眼睛酸痛，甚至可能有暫時性失明的情況，情況緊急時就不得延誤治療。此外，罹患心臟病、肝炎、糖尿病等慢性病患者，若不得已要進行拔牙時，建議到醫院住院治療，以策安全。